Στο νοτιότερο τμήμα της προστατευόμενης περιοχής του Εθνικού Πάρκου Δέλτα Αξιού, βρίσκεται η Λιμνοθάλασσα Αλυκής Κίτρους, μια περιοχή έκτασης περίπου 15.000 στρ., η οποία περιλαμβάνει τόσο την ίδια τη λιμνοθάλασσα του Κίτρους, που φιλοξενεί την μονάδα παραγωγής αλατιού, όσο και τους υγροτόπους που εκτείνονται στα νότια της, έως και τον Κορινό.

Η περιοχή έχει ιδιαίτερη αξία ως προς τη βιοποικιλότητα και κυρίως ως προς ορνιθοπανίδα, την ερπετοπανίδα, καθώς φιλοξενεί μεγάλους αριθμούς παρυδάτιων πουλιών (φοινικόπτερα) που τρέφονται, διαχειμάζουν και αναπαράγονται στην περιοχή, αλλά και τα είδη χλωρίδας που συναντά κανείς εκεί, χάρη στη μεγάλη ποικιλία που περιλαμβάνει: από τα αβαθή νερά της λιμνοθάλασσας ως τους αλμυρόβαλτους του νότιου τμήματος, τους παράκτιους θαμνότοπους και τις αμμοθίνες που εκτείνονται παράλληλα με την παράκτια ζώνη.

Η περιοχή ανήκει στο Δικτύου Natura 2000 ως Ειδική Ζώνη Διατήρησης «ΑΛΥΚΗ ΚΙΤΡΟΥΣ – ΕΥΡΥΤΕΡΗ ΠΕΡΙΟΧΗ».